MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia sp. YI23 chromosome 2

Total Repeats: 42622

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016625	CAT	2	6	5388	5393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377812246
2	NC_016625	TGC	2	6	5435	5440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377812246
3	NC_016625	ACG	2	6	5482	5487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377812246
4	NC_016625	CGAG	2	8	5488	5495	25 %	0 %	50 %	25 %	377812246
5	NC_016625	CCG	2	6	5518	5523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377812246
6	NC_016625	AACC	2	8	5531	5538	50 %	0 %	0 %	50 %	377812246
7	NC_016625	GCGGCC	2	12	5563	5574	0 %	0 %	50 %	50 %	377812246
8	NC_016625	AAC	2	6	5641	5646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	377812246
9	NC_016625	CGC	2	6	5648	5653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377812246
10	NC_016625	A	6	6	5659	5664	100 %	0 %	0 %	0 %	377812246
11	NC_016625	CG	3	6	5675	5680	0 %	0 %	50 %	50 %	377812246
12	NC_016625	ACC	2	6	5700	5705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	377812246
13	NC_016625	CAACG	2	10	5792	5801	40 %	0 %	20 %	40 %	377812246
14	NC_016625	GGT	2	6	5852	5857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	377812246
15	NC_016625	GAT	2	6	5940	5945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377812246
16	NC_016625	GC	3	6	5957	5962	0 %	0 %	50 %	50 %	377812246
17	NC_016625	GCC	2	6	5979	5984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377812246
18	NC_016625	CGAAA	2	10	5999	6008	60 %	0 %	20 %	20 %	377812246
19	NC_016625	CCG	2	6	6095	6100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377812247
20	NC_016625	CGC	2	6	6104	6109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377812247
21	NC_016625	CG	3	6	6123	6128	0 %	0 %	50 %	50 %	377812247
22	NC_016625	CG	3	6	6158	6163	0 %	0 %	50 %	50 %	377812247
23	NC_016625	CG	3	6	6194	6199	0 %	0 %	50 %	50 %	377812247
24	NC_016625	CGA	2	6	6219	6224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377812247
25	NC_016625	GCC	2	6	6244	6249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377812247
26	NC_016625	GC	3	6	6254	6259	0 %	0 %	50 %	50 %	377812247
27	NC_016625	TCG	2	6	6281	6286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377812247
28	NC_016625	TCGC	2	8	6301	6308	0 %	25 %	25 %	50 %	377812247
29	NC_016625	GAG	2	6	6409	6414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	377812247
30	NC_016625	TGC	2	6	6431	6436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377812247
31	NC_016625	TCA	2	6	6438	6443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377812247
32	NC_016625	CGT	2	6	6519	6524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377812247
33	NC_016625	CCGAT	2	10	6545	6554	20 %	20 %	20 %	40 %	377812247
34	NC_016625	GCC	2	6	6559	6564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377812247
35	NC_016625	CG	4	8	6588	6595	0 %	0 %	50 %	50 %	377812247
36	NC_016625	CGG	2	6	6645	6650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377812247
37	NC_016625	GCGA	2	8	6652	6659	25 %	0 %	50 %	25 %	377812247
38	NC_016625	TCG	2	6	6666	6671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377812247
39	NC_016625	CG	3	6	6697	6702	0 %	0 %	50 %	50 %	377812247
40	NC_016625	CGG	2	6	6774	6779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377812247
41	NC_016625	CGC	2	6	6936	6941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377812247
42	NC_016625	TGC	2	6	6943	6948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377812247
43	NC_016625	CTTG	2	8	7011	7018	0 %	50 %	25 %	25 %	377812247
44	NC_016625	CGA	2	6	7267	7272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377812248
45	NC_016625	CG	3	6	7332	7337	0 %	0 %	50 %	50 %	377812248
46	NC_016625	GCC	2	6	7353	7358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377812248
47	NC_016625	ATC	2	6	7361	7366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377812248
48	NC_016625	CGC	2	6	7423	7428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377812248
49	NC_016625	GC	3	6	7427	7432	0 %	0 %	50 %	50 %	377812248
50	NC_016625	GGC	2	6	7457	7462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377812248
51	NC_016625	GCC	2	6	7503	7508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377812248
52	NC_016625	CCG	2	6	7515	7520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377812248
53	NC_016625	TCG	2	6	7551	7556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377812248
54	NC_016625	CGT	2	6	7585	7590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377812248
55	NC_016625	GGC	3	9	7633	7641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377812248
56	NC_016625	CGG	2	6	7672	7677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377812248
57	NC_016625	GC	3	6	7739	7744	0 %	0 %	50 %	50 %	377812248
58	NC_016625	CGG	2	6	7755	7760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377812248
59	NC_016625	GAC	2	6	7792	7797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377812248
60	NC_016625	TCG	2	6	7802	7807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377812248
61	NC_016625	TCG	2	6	7956	7961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377812248
62	NC_016625	CG	3	6	8001	8006	0 %	0 %	50 %	50 %	377812248
63	NC_016625	TCA	2	6	8013	8018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377812248
64	NC_016625	TCG	2	6	8025	8030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377812248
65	NC_016625	CGA	2	6	8052	8057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377812248
66	NC_016625	CGC	2	6	8064	8069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377812248
67	NC_016625	CG	3	6	8198	8203	0 %	0 %	50 %	50 %	377812248
68	NC_016625	TCA	2	6	8220	8225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377812248
69	NC_016625	CGG	2	6	8238	8243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377812248
70	NC_016625	ACG	2	6	8322	8327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377812248
71	NC_016625	CGG	2	6	8337	8342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377812248
72	NC_016625	TTC	2	6	8390	8395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	377812248
73	NC_016625	CAT	2	6	8404	8409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377812248
74	NC_016625	GTCG	2	8	8416	8423	0 %	25 %	50 %	25 %	377812248
75	NC_016625	GAGC	2	8	8452	8459	25 %	0 %	50 %	25 %	377812248
76	NC_016625	GC	4	8	8483	8490	0 %	0 %	50 %	50 %	377812248
77	NC_016625	CG	3	6	8521	8526	0 %	0 %	50 %	50 %	377812248
78	NC_016625	CGA	2	6	8551	8556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377812248
79	NC_016625	GCATT	2	10	8557	8566	20 %	40 %	20 %	20 %	377812248
80	NC_016625	GCC	2	6	8629	8634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377812248
81	NC_016625	TCA	2	6	8643	8648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377812248
82	NC_016625	CGG	3	9	8746	8754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377812248
83	NC_016625	GAC	2	6	8774	8779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377812248
84	NC_016625	CG	3	6	8800	8805	0 %	0 %	50 %	50 %	377812248
85	NC_016625	TGC	2	6	8817	8822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377812248
86	NC_016625	CG	3	6	8849	8854	0 %	0 %	50 %	50 %	377812248
87	NC_016625	CGC	2	6	8866	8871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377812248
88	NC_016625	CGG	2	6	8932	8937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377812248
89	NC_016625	GAGC	2	8	9006	9013	25 %	0 %	50 %	25 %	377812248
90	NC_016625	GTC	2	6	9057	9062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377812249
91	NC_016625	GCG	2	6	9070	9075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377812249
92	NC_016625	GCG	2	6	9090	9095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377812249
93	NC_016625	TCG	2	6	9097	9102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377812249
94	NC_016625	GC	4	8	9121	9128	0 %	0 %	50 %	50 %	377812249
95	NC_016625	GCC	2	6	9234	9239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377812249
96	NC_016625	CG	3	6	9246	9251	0 %	0 %	50 %	50 %	377812249
97	NC_016625	CGA	2	6	9254	9259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377812249
98	NC_016625	CAA	2	6	9296	9301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	377812249
99	NC_016625	ACG	2	6	9310	9315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377812249
100	NC_016625	TCA	2	6	9320	9325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377812249
101	NC_016625	TTC	2	6	9387	9392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	377812249
102	NC_016625	GC	3	6	9419	9424	0 %	0 %	50 %	50 %	377812249
103	NC_016625	CG	4	8	9539	9546	0 %	0 %	50 %	50 %	377812249
104	NC_016625	CGC	2	6	9601	9606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377812249
105	NC_016625	AGCGA	2	10	9636	9645	40 %	0 %	40 %	20 %	377812249
106	NC_016625	GCA	2	6	9656	9661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377812249
107	NC_016625	CG	3	6	9695	9700	0 %	0 %	50 %	50 %	377812249
108	NC_016625	CGA	2	6	9722	9727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377812249
109	NC_016625	GC	3	6	9732	9737	0 %	0 %	50 %	50 %	377812249
110	NC_016625	CG	4	8	9743	9750	0 %	0 %	50 %	50 %	377812249
111	NC_016625	GGT	2	6	9769	9774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	377812249
112	NC_016625	CG	3	6	9823	9828	0 %	0 %	50 %	50 %	377812250
113	NC_016625	GC	3	6	9839	9844	0 %	0 %	50 %	50 %	377812250
114	NC_016625	TGC	2	6	9894	9899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377812250
115	NC_016625	TCG	2	6	9930	9935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377812250
116	NC_016625	CGT	2	6	10021	10026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377812250
117	NC_016625	TCT	2	6	10130	10135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	377812250
118	NC_016625	GCT	2	6	10495	10500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377812251
119	NC_016625	GCT	2	6	10506	10511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377812251
120	NC_016625	CG	3	6	10525	10530	0 %	0 %	50 %	50 %	377812251
121	NC_016625	AGCGCA	2	12	10552	10563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377812251
122	NC_016625	CCG	2	6	10568	10573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377812251
123	NC_016625	AAC	2	6	10619	10624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	377812251
124	NC_016625	GCC	2	6	10693	10698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377812251
125	NC_016625	GC	3	6	10794	10799	0 %	0 %	50 %	50 %	377812251
126	NC_016625	GACC	2	8	10828	10835	25 %	0 %	25 %	50 %	377812251
127	NC_016625	GC	3	6	10849	10854	0 %	0 %	50 %	50 %	377812251
128	NC_016625	CGC	2	6	10857	10862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377812251
129	NC_016625	CGAT	2	8	10905	10912	25 %	25 %	25 %	25 %	377812251
130	NC_016625	ATC	2	6	10959	10964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377812251
131	NC_016625	GGCA	2	8	10995	11002	25 %	0 %	50 %	25 %	377812251
132	NC_016625	GGC	2	6	11003	11008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377812251
133	NC_016625	CCG	2	6	11009	11014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377812251
134	NC_016625	GATG	2	8	11043	11050	25 %	25 %	50 %	0 %	377812251
135	NC_016625	CGA	2	6	11092	11097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377812251
136	NC_016625	ACGC	2	8	11099	11106	25 %	0 %	25 %	50 %	377812251
137	NC_016625	CG	3	6	11149	11154	0 %	0 %	50 %	50 %	377812251
138	NC_016625	CG	3	6	11168	11173	0 %	0 %	50 %	50 %	377812251
139	NC_016625	CGG	2	6	11208	11213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377812251
140	NC_016625	GCGCG	2	10	11214	11223	0 %	0 %	60 %	40 %	377812251
141	NC_016625	GC	3	6	11283	11288	0 %	0 %	50 %	50 %	377812251
142	NC_016625	GGC	2	6	11294	11299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377812251
143	NC_016625	CATG	2	8	11347	11354	25 %	25 %	25 %	25 %	377812251
144	NC_016625	GCA	2	6	11356	11361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377812251
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146	NC_016625	TGCG	2	8	11400	11407	0 %	25 %	50 %	25 %	377812251
147	NC_016625	GTTC	2	8	11433	11440	0 %	50 %	25 %	25 %	377812251
148	NC_016625	CGA	2	6	11449	11454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377812251
149	NC_016625	CGA	2	6	11461	11466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377812251
150	NC_016625	GCC	2	6	11467	11472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377812251
151	NC_016625	CG	3	6	11491	11496	0 %	0 %	50 %	50 %	377812251
152	NC_016625	CCG	2	6	11511	11516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377812251
153	NC_016625	CGG	2	6	11562	11567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377812251
154	NC_016625	GCT	2	6	11821	11826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377812252
155	NC_016625	CGG	2	6	11827	11832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377812252
156	NC_016625	GC	3	6	11899	11904	0 %	0 %	50 %	50 %	377812252
157	NC_016625	CGC	2	6	11972	11977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377812252
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159	NC_016625	CCA	2	6	12039	12044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	377812252
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162	NC_016625	CGC	2	6	12151	12156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377812252
163	NC_016625	CG	3	6	12213	12218	0 %	0 %	50 %	50 %	377812252
164	NC_016625	TCG	2	6	12222	12227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377812252
165	NC_016625	TCGA	2	8	12254	12261	25 %	25 %	25 %	25 %	377812252
166	NC_016625	TCA	2	6	12306	12311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377812252
167	NC_016625	CGC	2	6	12325	12330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377812252
168	NC_016625	CTGATG	2	12	12347	12358	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	377812252
169	NC_016625	TGC	2	6	12378	12383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377812252
170	NC_016625	GTC	2	6	12395	12400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377812252
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172	NC_016625	CGA	2	6	12451	12456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377812252
173	NC_016625	CGA	2	6	12493	12498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377812252
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180	NC_016625	CGG	2	6	12711	12716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377812252
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248	NC_016625	CGC	2	6	14993	14998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377812254
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250	NC_016625	CGA	2	6	15067	15072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377812254
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253	NC_016625	GC	3	6	15120	15125	0 %	0 %	50 %	50 %	377812254
254	NC_016625	CGA	2	6	15162	15167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377812255
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258	NC_016625	GC	3	6	15289	15294	0 %	0 %	50 %	50 %	377812255
259	NC_016625	ACG	2	6	15329	15334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377812255
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262	NC_016625	CGG	2	6	15451	15456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377812255
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393	NC_016625	GC	3	6	19789	19794	0 %	0 %	50 %	50 %	377812258
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